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promiscuità genetica interspecie


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avatarsenior
inviato il 15 Giugno 2021 ore 20:35

se io fossi un filosofo tu saresti un mio promettente discepolo.
sempre un po' mal girato, un po' scavolato, ma con la fortuna immensa della curiosità, del senso critico
e consapevole del valore della domanda e della dialettica,
anche se dai troppa fiducia alle battute brevi. :-P

avatarjunior
inviato il 15 Giugno 2021 ore 21:11

Premesso che non è mia intenzione far bannare nessuno (sono del parere che ognuno si debba "divertire" come crede, ovviamente sempre nel rispetto delle regole, dell'educazione e senza fare disinformazione), il "modus operandi" di ooo è ormai abbastanza noto: parte da un fatto vero o comunque verosimile e poi con un volo pindarico cerca di portare avanti delle sue tesi personali, come se fosse un mutatis mutandis del fatto di partenza.
Nella fattispecie, partendo da un articolo, comunque interessante, ma che descrive un fatto specifico, arriva a dire che per la prima volta si è scoperto che l'informazione genetica può passare da RNA a DNA, che invece è cosa ben nota da decenni, ma che poi questo, a sua volta, porta a un sottinteso...il sottinteso, se capisco bene, ma posso anche sbagliare, potrebbe essere che i vaccini a RNA andrebbero a modificare il nostro DNA...beh, se per caso fosse così, è bene dire subito e a chiare lettere che questa tesi complottista e no-vax è una colossale BAGGIANATA, come tutte quelle tesi complottistiche analoghe, che non sono e non possono essere dimostrate scientificamente: puro fumo negli occhi, da condannare sempre senza se e senza ma.

avatarsenior
inviato il 15 Giugno 2021 ore 21:28

se io fossi un filosofo tu saresti un mio promettente discepolo.
sempre un po' mal girato, un po' scavolato, ma con la fortuna immensa della curiosità, del senso critico
e consapevole del valore della domanda e della dialettica,
anche se dai troppa fiducia alle battute brevi. :-P

ahahaha

avatarsenior
inviato il 16 Giugno 2021 ore 0:16

leggendo alcuni interventi, ho la sensazione che non sia chiara la rilevanza della pubblicazione scientifica,
quindi per gli ignoranti come me che mal bazzicano l'inglese mi permetto di pubblicare alcuni passi tradotti con google traslate, e magari metto in grassetto le questioni importanti:


- I ribonucleotidi incorporati nel genoma arrestano le DNA polimerasi replicative (Pols) e causano rotture del DNA. Rimane sconosciuto se i Pols di riparazione del DNA dei mammiferi utilizzino in modo efficiente i ribonucleotidi modello e promuovano la sintesi di riparazione del DNA modellata da RNA. Troviamo che la Pol? umana inversa trascrive l'RNA, in modo simile alle trascrittasi inverse retrovirali (RT). Pol? mostra una velocità e una fedeltà significativamente più elevate di incorporazione del desossiribonucleotide sull'RNA rispetto al DNA . La struttura cristallina 3.2-Å di Pol? su un primer-modello di DNA/RNA con desossiribonucleotide legato rivela che l'enzima subisce un'importante trasformazione strutturale all'interno del sottodominio del pollice per adattarsi al DNA/RNA della forma A e forma più legami idrogeno con il ribosio modello 2? -gruppi idrossilici come RT retrovirali. Infine, troviamo che Pol? promuove la riparazione del DNA modello RNA nelle cellule di mammifero. Questi risultati suggeriscono che Pol? è stato selezionato per accogliere i ribonucleotidi stampo durante la riparazione del DNA.

- Curiosamente, Pol? ha un dominio di correzione di bozze inattivo a causa di mutazioni acquisite (Fig. 1A) (2). L'inattivazione della funzione di correzione di bozze 3'-5' del frammento di Pol I Klenow (KF) batterico della famiglia A strettamente correlato consente a questa polimerasi di trascrivere inversamente l'RNA come le trascrittasi inverse retrovirali (RT), che mancano di attività di correzione di bozze (fig. S1A) (17, 18). Poiché Pol? è altamente soggetto a errori e promiscuo e contiene un dominio di correzione di bozze inattivo, abbiamo ipotizzato che abbia un'attività di sintesi del DNA RNA-dipendente. Dato che i ribonucleotidi sono la lesione nucleotidica più frequente nel DNA genomico che arrestano i Pol replicativi e causano rotture del DNA (19, 20), abbiamo anche previsto che Pol? tollerasse i ribonucleotidi stampo durante le sue attività di riparazione del DNA e quindi promuovesse la sintesi di riparazione del DNA basata su RNA. (riparazione RNA-DNA). Sebbene i meccanismi di riparazione RNA-DNA siano stati dimostrati in cellule di lievito geneticamente modificate (21, 22), rimangono oscuri nelle cellule di mammifero.

- Abbiamo testato se il dominio della polimerasi di Pol? (qui denominato Pol?) trascrive inversamente l'RNA come l'HIV RT utilizzando un primer del DNA ricotto a un modello di RNA (DNA/RNA) . Pol? mostra un tasso di attività RT simile a quello dell'HIV RT in condizioni identiche utilizzando quantità substechiometriche di enzima rispetto allo stampo
(Fig. 1, B e C). Precedenti studi hanno indicato che la Pol? umana ha attività RT ad alte concentrazioni micromolari (23). Troviamo che Pol? non riesce a eseguire la trascrizione inversa oltre i 3 nucleotidi (nt) utilizzando condizioni identiche a quelle di Pol? e HIV RT a concentrazioni multiple (Fig. 1, B e C; confrontare Fig. 1F con Fig. 1, D ed E; figura 1G). Tuttavia, a concentrazioni significativamente più elevate, Pol? può estendere ulteriormente il DNA/RNA (figg. S1, da B a E). I controlli mostrano che Pol? è attivo su uno stampo di DNA/DNA come Pol? e HIV RT (confrontare la Fig. 1F con la Fig. 1, D ed E; Fig. 1G). Nel complesso, Pol? mostra un maggiore stallo sull'RNA e richiede una maggiore concentrazione di enzimi rispetto a Pol? per la trascrizione inversa (figg. S1, da B a E). L'attività di sintesi del DNA dipendente dall'RNA di Pol? è osservata in varie condizioni e su diversi costrutti stampo (figg. S1, F e G) e sequenze (fig. S1H). Nonostante la sua robusta attività sull'RNA, Pol? discrimina fortemente l'incorporazione di ribonucleotidi (fig. S1I). Il sequenziamento del DNA complementare (cDNA) conferma l'attività di sintesi del DNA dipendente dall'RNA di Pol? (fig. S2A) e rivela misincorporazioni di nucleotidi e indel, che è coerente con la sua attività di sintesi del DNA a bassa fedeltà (fig. S2A) (3). Anche l'HIV RT e altri retrovirus RT sono altamente soggetti a errori, dimostrando una caratteristica condivisa tra Pol? e RT retrovirali (18, 24-28). Oltre all'HIV RT, l'attività di Pol? sull'RNA è quasi identica agli RT codificati dal virus della leucemia murina Moloney (M-MuLV) e dal virus della mieloblastosi aviaria (AMV) (Fig. 1H). Pol? mostra eventi di pausa quasi identici a quelli dei retrovirus RT, il che è coerente con le tendenze di pausa per gli RT (Fig. 1H) (29, 30). La sintesi del cDNA di Pol? sull'RNA sintetico è simile agli RT M-MuLV e AMV (Fig. 1I e fig. S2B), e Pol? promuove anche la sintesi del cDNA dell'RNA ribosomiale purificato di Escherichia coli 16S simile agli RT M-MuLV e AMV (fig. S2C ).

- Pol? mostra una maggiore velocità e fedeltà dell'incorporazione del desossiribonucleotide sull'RNA

Abbiamo testato la velocità relativa dell'incorporazione di Pol? desossiribonucleoside monofosfato (dNMP) sull'RNA rispetto al DNA. I singoli deossiribonucleosidi trifosfati (dNTP) sono stati incubati con Pol? durante un andamento temporale su DNA/RNA rispetto a DNA/DNA con sequenza identica (Fig. 2A). Pol? mostra una velocità significativamente maggiore di incorporazione di deossicitidina monofosfato
(dCMP), deossitimidina monofosfato (dTMP) e deossiadenosina monofosfato (dAMP) sull'RNA (Fig. 2, da B a D e fig. S4B). La velocità di incorporazione della deossiguanosina monofosfato (dGMP) era simile su RNA e DNA (Fig. 2E). Fl-Pol? mostra anche tassi più elevati di incorporazione di dCMP, dTMP e dAMP sull'RNA (fig. S5). Pol? mostra una doppia affinità per DNA/RNA (fig. S4C), che può contribuire alla maggiore velocità di incorporazione dei nucleotidi.

direi che la questione molto rilevante è che si è trovato un meccanismo d'azione che supera in velocità ed efficacia quelli fino ad ora conosciuti.
In biologia la velocità e l'efficacia sono determinanti.
La biologia vive di "competizioni" di processi chimici, quali reazioni attive e non partecipate (enzimatiche).
é deteminante nell'azione biolgogica quello che avviene per primo, quindi un evento biologico è generato proprio dalla rapidità del processo, dalla sua efficacia, e non dall'ipotetica risultante matematica teorica di una determinate reazione, possibile certamente nelle aule didattiche, ma mai ottenibile nella relatà.
Quindi i processi già conosciuti di integrazione di segmenti all'interno della doppia elica possono solo inginocchiarsi di fronte a questa scoperta che sbarazza la speculazione teorica al fronte dell'efficacia reattiva verificata.

avatarsenior
inviato il 16 Giugno 2021 ore 5:15

@Antonche come mai è così difficile infinocchiare umili chimici come te e me?
Siamo esseri superiori?MrGreen
Se hai tempo: "Q di Qomplotto" di Wu Ming 1, appena uscito. Ne ho letto il 25%, analisi lucida e corretta finora, non so cosa scrive nel restante 75% però.

avatarjunior
inviato il 16 Giugno 2021 ore 10:47

on dall'ipotetica risultante matematica teorica di una determinate reazione, possibile certamente nelle aule didattiche, ma mai ottenibile nella relatà.
Quindi i processi già conosciuti di integrazione di segmenti all'interno della doppia elica possono solo inginocchiarsi di fronte a questa scoperta che sbarazza la speculazione teorica al fronte dell'efficacia reattiva verificata.

Ma che significa? Eeeek!!! Boh...
Come sempre, in risposta ad obiezioni semplici e coerenti si inizia a elucubrare con fiumi di parole, che capziosamente allontanano dal nocciolo della questione, cercando di confondere le acque...

@Antonche come mai è così difficile infinocchiare umili chimici come te e me?
Siamo esseri superiori?MrGreen

Beh, caro Valgrassi (ne approfitto anche per salutarti ;-)) io penso che non serva essere chimici o scienziati per capire il tenore di certe bufale...basterebbe solo un minimo di buonsenso: mi è capitato di parlare con persone anziane che, con una semplice licenza elementare, deridevano allegramente queste teorie "complottiste"... MrGreen

Se hai tempo: "Q di Qomplotto" di Wu Ming 1, appena uscito. Ne ho letto il 25%, analisi lucida e corretta finora, non so cosa scrive nel restante 75% però.

Appena possibile lo leggerò... certo, ingenuamente forse, mi risulta difficile comprendere come sia possibile che questi esaltati di QAnon possano ancora essere liberi di continuare a far danni...Triste

avatarsenior
inviato il 16 Giugno 2021 ore 12:47

Valgrassi, Antonche, ma sul serio avete buttato i migliori anni della vostra vita a studiare chimica? Che poveracci... Ma non potetevate fare come fanno i nostri nuovi esperti?
Si studia di focus.it, poi si traducono (a minchia) con google translate degli articoli (ma solo quelli che possono tornare utili), si copia-incolla tutto su un forum. Con questo completi il primo ciclo. Per il Master si devono seguire almeno due serie di Le Iene e se vuoi la lode - ovviamente - devi guardare il canale TV sponsorizzato bellamente nell'avatar dell'ospite di questo interessate thread.

Caro Oooo, ci vorresti far sapere, in maniera non contorta e senza copia-incolla, quale sarebbe secondo te l'enorme interesse di queste scoperte? Dal punto di vista traslazionale, per l'impatto che questa dovesse avere sul genere umano, cosa potrebbe comportare secondo te? Vorresti vuotare il sacco, o forse gli interventi di questi quattro rompicugghiuni saputelli ha reso più complicato il tuo processo elucubrativo.



avatarsenior
inviato il 16 Giugno 2021 ore 13:50

Beh, caro Valgrassi (ne approfitto anche per salutarti

anche io Valgrassi, ti volevo salutare anche io.

avatarsenior
inviato il 16 Giugno 2021 ore 14:28

Altra mirabolante tecnica comunicativa dei nuovi esperti di tutto.
Evitare di rispondere alle domande scomode. Tecnica non originalissima, ma efficace.

PS: ciao Valgrassi

avatarjunior
inviato il 16 Giugno 2021 ore 15:08

@Teofilatto
Mi hai fatto davvero ridere di gusto!!!
Ma quello che hai detto con una intelligente ironia, corrisponde purtroppo in molti casi alla realtà...Triste
Prescindendo dal post in questione e passando ad una discussione di carattere generale, c'è qualcuno che ancora crede che la storiella dell' "uno vale uno" si possa applicare anche al metodo scientifico e alla scienza in generale... mah...Confuso

P.S. rinnovo i miei saluti, Valgrassi ;-) MrGreen

avatarsenior
inviato il 16 Giugno 2021 ore 16:28

Caro Antonche,
purtroppo, per motivi professionali, devo quotidianamente perorare la causa della competenza e del valore della consocenza (quella sudata con gli studi, non su Rieducescional Channel....) sulla pseudoinformazione. Ne va della salute della gente. Per questo sono livoroso, anzi proprio incatzato con questa forma di populismo scientifico demenziale.


PS: Valgrà, salutoni

avatarjunior
inviato il 16 Giugno 2021 ore 17:42

Teofilatto, ti capisco e sono perfettamente in linea con quello che dici, avendo anche intuito a cosa ti riferisci.
Sono sempre più convinto che questa forma di populismo scientifico demenziale, come la chiami giustamente tu, va combattuta in ogni sede e con ogni mezzo culturale, affinché la ragione prevalga sempre sull'irrazionale e deleterio oscurantismo.
P.s. mi scuso per l' OT.

P.P.s. Val, baci e abbracci!

avatarsenior
inviato il 16 Giugno 2021 ore 18:14

E intanto il nostro è scomparso dall'arena pubblica. Per fortuna vedo che ha appena scoperto che Cristoforo Colombo non è stato il primo a scoprire l'america. Domani c'è la puntata sulle sfingi costruite dagli alieni. Stay tuned!

L'occasione è gradita per porgere cordiali saluti all'amico Valgrassi.

Ps: amico Ooo, farti andare in vacca questa discussione probabilmente ti salverà da un altro ban. Ringrazia.

avatarsenior
inviato il 16 Giugno 2021 ore 18:25

Siete cattivissimi!:-P
Salutiamo sempre ValgrassiSorriso

avatarjunior
inviato il 16 Giugno 2021 ore 18:45

Nooo, a quello su Cristoforo Colombo non partecipo perché non sono uno storico... certo potrei sempre fare un copia/incolla di qualcosa però...MrGreen

P.s. Val, un caro saluto anche alla famiglia!

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